中草藥的種類繁多，總數約在八千種左右，常用中草藥亦有700種左右。中草藥的教科書所採用的分類方法，根據其目的與重點而有不同，主要有下列四種：

 

        按藥物功能分類─解毒藥、清熱藥、理氣藥、活血化瘀藥等。

        按藥用部分分類─根類、葉類、花類、皮類等。

        按有效成分分類─含生物鹼的中草藥、含揮發油的中草藥。

        按自然屬性和親緣關系分類──先把中草藥分為植物藥、動物藥和礦物藥。動植物藥材再根據其原植物原動物的親緣關系來分類和排列次序。如麻黃科、木蘭科、毛茛科等等。